کمیسیون شکایات انتخاباتی یک نهاد مستقل افغانی می باشد که بر اساس ماده ۵۲ قانون انتخابات برای تصمیم گیری در مورد تمام اعتراضات و شکایات مربوط به پروسه انتخابات ایجاد شده است. کمیسیون شکایات انتخاباتی برای انتخابات سال ۱۳۸۸ دوباره تاسیس گردیده است. کمیسیون شکایات انتخاباتی می تواند به شکایات در مورد نقض قانون انتخابات طوری که در ماده ۵۳ قانون انتخابات مشخص شده است رسیده گی نماید و همچنان می تواند مطابق ماده ۵۴ محدودیت های را در صورت که مشخص شود که خلاف رفتاری صورت گرفته است وضع نماید. علاوتا کمیسیون شکایات انتخاباتی می تواند به اعتراضات در مورد شایستگی نامزدان رسیده گی نماید.
طبق قانون انتخابات ، کمیسیون شکایات انتخاباتی متشکل از دو کمیشنر ملی و سه کمیشنر بین المللی میباشد. یک کمشنر توسط کمیسیون حقوق بشر افغانستان و دیگر آن از طرف ستره محکمه گماشته شده اند. سه تن کمشنر بین المللی از طرف نماینده خاص سرمنشی سازمان ملل متحد منصوب گردیده اند. کمیسیون شکایات انتخاباتی سال ۲۰۰۹ متشکل از کمیشنرهای ملی، فهیم حکیم و مولوی مصطفی بارکزی میباشد. کمیشنرهای بین المللی گراند کیپن، مارتن هالف، و اسکات واردن میباشند.
دفتر مرکزی کمیسیون شکایات انتخاباتی در کابل می باشد. دفاتر ولایتی کمیسیون شکایات انتخاباتی در تمام ولایات افغانستان از کمیسیون نماینده گی می نمایند. هر دفتر ولایتی کمیسیون شکایات انتخاباتی شامل سه کمیشنر و یک آمر حمایوی میباشد. هشت دفتر ولایتی دارای امکانات و ظرفیت های اضافی عدلی وتحقیقاتی خواهند بود که در صورت ضرورت دیگر دفاتر ولایتی را کمک خواهند کرد.
هر شخص و سازمان که نفع مشروع در انتخابات داشته باشد و ادعا دارد که تخطی از قانون انتخابات در جریان پروسه انتخاباتی صورت گرفته است، حق درج شکایت در کمیسیون شکایات انتخاباتی و دفاتر ولایتی کمیسیون شکایات انتخاباتی را دارد. این حق شامل تمام رای دهنده گان و نماینده گان کاندیدان نیز میشود. کمیسیون شکایات انتخاباتی از کمیسیون مستقل انتخابات جدا و مستقل میباشد.
